Akai QX-3700 User Manual download pdf (Page 13)

Przy ułożeniu typu DR oba monomery znajdują

się po tej samej stronie helisy DNA, zajmując przy

ległe głębokie rowki. Dodatkowa a-helisa, znaj

dująca się w C-końcowej wypustce LBD cząsteczki

RXR umożliwia jej oddziaływanie także z płytkim

rowkiem DNA, co rozszerza powierzchnię kontaktu

poza HRE.

Zastanawiający wydawał się fakt, że tak wiele

różnych receptorów wiąże się z tym samym partne

rem, a każdy heterodimer rozpoznaje swoisty HRE w

zależności od niewielkiej przecież różnicy liczby nu-

Tabela 1

ratywność i wzmacnia wiązania powstające między

DBD obu monomerów a półmiejscami HRE [10].

Przyjęto dwustopniowy model wiązania receptora

z DNA po związaniu ligandów. Zakłada on, że naj

pierw łączą się odpowiednie motywy LBD obu mo

nomerów i tworzy się rozpuszczalny dimer. Następ

nie DBD cząsteczki RXR wiąże się z 5’-półmiej-

scem HRE, co udostępnia półmiejsce 3’ partnerowi.

Po połączeniu domen E z HRE, także domeny C obu

monomerów asocjują ze sobą. W zależności od ro

dzaju partnera oraz lokalizacji tkankowej, RXR

Przykłady receptorów, tworzących dimery z RXR

Receptor

Konfiguracja HRE

Ligand

RXR

DR-1, IR-0

kwas 9-cis-retinowy

PPAR

DR-1

kwasy tłuszczowe, HETE, PGJ, fibraty, rezulina

RAR DR-2, DR-5, IR-0

kwas retinowy

RAR*

DR-1

kwas retinowy

VDR DR-3

1,25-dihydroksykalcyferol

TR DR-4

hormony tarczycy

LXR

DRA

oksosterole

FXR IR-1

deoksycholany, famezoidy u myszy

PXR

ksenobiotyki, endogenne steroidy

CAR**

DR-5

hamowany przez androstanol

NGFIB**

DR-5

COUP** DR-0

* — hamuje transkrypcją, ** — aktywuje transkrypcją w nieobecności liganda; HRE — element odpowiedzi hormonalnej w DNA; DR —

proste powtórzenie; IR — odwrócone (palindrom owc) powtórzenie

kleotydów oddzielających półmiejsca. Krystalogra

ficzne badania dimeru TR/RXR przyczyniły się do

zrozumienia tego zjawiska. Tworząc modele o

zmiennej długości łącznika wykazano, że zmiana o

jeden nukleotyd powoduje obrót monomeru partnera

o 36° wokół płytkiego rowka DNA, co wymusza

zmianę położenia RXR i udostępnienie odpowied

niej powierzchni heterodimeryzacji w jego domenie

E. Jak się wydaje, każdy z receptorów jądrowych ma

tylko jeden motyw dimeryzacji, zaś RXR — komplet

motywów, swoistych dla każdego partnera. Badania

te wykazały także, że motywy dimeryzacji występują

nie tylko w LBD, ale i w DBD. Inaczej niż w syme

trycznych HRE hormonów steroidowych, ułożenie

monomerów na DR wymusza wzajemne interakcje

odmiennych miejsc domen DBD w RXR i jego part

nerze. Reszty aminokwasowe drugiego palca cynko

wego RXR reagują z pierwszym palcem cynkowym

partnera dimeru. Utworzenie innego dimeru, niż jest

to zaprogramowane w danym HRE stanowiłoby sfe

ryczna przeszkodę asocjacji DBD z DNA. Interakcja

HRE z właściwym heterodimerem umożliwia koope-

może pełnić rolę biernego czynnika „naprowa

dzającego” właściwy receptor , bądź też wykazywać

zdolność transaktywacyjną, właściwą dla swego li

ganda. W dimerach TR/RXR i VDR/RXR aktywność

9-c/s-RA jest tłumiona, natomiast w PPAR/RXR i

FXR/RXR oba monomery zachowują zdolność akty

wacji transkrypcji odpowiednich genów [3, 11].

IV. Receptory witamin i hormonów

IV-1. Receptory kwasu retinowego

Receptor kwasu retinowego (RAR) wiąże się ze

wszystkimi izomerami kwasu retinowego jak ATRA,

9-cis-RA

i 13-cA-RA. W obrębie tej grupy stwier

dzono obecność trzech izoform RAR, oznaczanych

odpowiednio jako a, P i y. Izoformy różnią się swo

imi właściwościami, a ich profil może się zmieniać w

zależności od okresu rozwoju płodowego [5, 12].

W swojej budowie RAR jest bardzo zbliżony do

RXR i z wyjątkiem domen A /B oraz obszaru AF-2

wykazuje znaczną z nim homologię. Domeny A i B

POSTĘPY BIOCHEMII 46(2), 2000

117

http://rcin.org.pl

1 2 ... 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 ... 94 95

Comments to this Manuals

No comments

Akai QX-3700 User Manual Page 13

Comments to this Manuals