IV-2. Redagowanie transkryptów genów nad roślin
Prawie wszystkie mRNA mitochondriów roślin
nych ulegają redagowaniu, w tym również transkryp-
ty genów nad. Jak pokazano w tabeli 2, ilość miejsc
redagowania w transkryptach genów nad jest dość
znaczna.
Redagowanie polega najczęściej na zamianie
C-U. Niektóre z opisanych przypadków odwrotnej
zamiany U-C wymagają jeszcze weryfikacji. Reda
gowanie prowadzi czasami do powstawania kodo-
nów „start”. W zależności od badanego materiału re
dagowanie transkryptów genów nad wykazuje pew
ne cechy charakterystyczne. U niektórych roślin, na
przykład u wiesiołka, redagowaniu ulega nie tylko 4
z 5 eksonów genu nad 1, ale i pojedynczy intron [92].
Charakterystyczną cechą redagowania genu nad 1
Tabela 2
Obraz redagow ania transkryptów genów nad roślin
wiesiołka jest również znaczny odsetek cytozyn ule
gających „cichemu” redagowaniu. W roślinie tej ist
nieje wyraźny związek pomiędzy redagowaniem a
splicingiem. Usunięcie intronu z nad 1 wymaga naj
pierw redagowania domeny VI intronu . Natomiast w
transkryptach nad\ petunii usunięcie intronów nie
jest wymagane do przebiegu procesu redagowania
[93]. '
W transkryptach pszenicy każdy ekson na dlulega
redagowaniu, a szczególny nadmiar miejsc redago
wania zawiera ekson III [94]. Redagowanie intronów
genu nadl zachodzi też w obrębie sekwencji mat-r
pszenicy i ziemniaka i dotyczy 13-15 konwersji C-U,
które zmieniają charakter potencjalnych domen ko
dowanych maturaz [95].
Redagowanie transkryptów genu n a dl prowadzi
nie tylko do zmian aminokwasów, ale również do
Gen
Badany materiał Liczba miejsc
redagowania
Uwagi
nad 1 Pszenica
Ziem niak
17
[94,95] redagowanie generuje kodon „start”
[95] redagow anie sekwencji mat-r (15 miejsc)
W iesiołek 28
[121]redagowanie mat-r; redag. generuje „start”
Petunia 23
[124]
n adl
Pszenica 36
[55]
W iesiołek
36
[96,127] w tym redagowanie intronów
Rzodkiewnik
33
[97] w tym redagowanie intronów
na dl Sosna
27
[100] częściowe redagow anie
Pszenica
21
[103] częściowe redagowanie; korelacja:
redagowanie - dojrzewanie m RNA
Ryż 5
[99]
Kukurydza
22
[104] częściowe redag.; kultury zawiesinow e;
Sorgo
19
[75]
W iesiołek
16
[102] częściowe redagow anie
Zeń-szeń
15
[128] redagowanie zbliżone do wiesiołka
Petunia
19
[105] częściowe redagow anie
Rzepak
10
[98] redagowanie różnicuje rodzaj Brassica
M agnolia
23
[51] częściowe redagowanie
Słonecznik
16
[51] częściowe redagowanie
Czosnek
21 [51] częściowe redagowanie
nad4
Pszenica
23
[106] całkowite redagow anie
Sałata
16
[108] całkowite redagow anie
Rzepa
36
[108] odmienna ilość miejsc redag. w eksonach
w porów naniu z pszenicą i sałatą
nadAL Rzodkiewnik
9
[109] częściowe redagowanie
nad5
W ątrobowce:
[66] redagowanie badano we fragmencie
glewiki
jungerm aniow ce
Mchy
37-50
2-21
1-9
transkryptu genu nadS
W iesiołek 27
[110]
Rzodkiewnik 9
[110]
nad6
Pszenica
15
[58]
Kukurydza
12
[111]
nad l
Pszenica
32
[113] niektóre zm iany są częściowe
Ziem niak 3
[112] redagow anie I eksonu
nad9
Pszenica 15
[115]
Ryż
12
[118]
Burak zwyczajny 5
[150]
Ziemniak 7
[116]
POSTĘPY BIOCHEMII 46(2), 2000
171
Comments to this Manuals